Nello screenshot di figura è mostrata il menù delle opzioni avanzate di connessione di FileZilla dove è possibile scegliere: il tipo di server, la cartella locale predefinita dei file del sito, la cartella predefinita del server da aprire alla connessione e la regolazione del fuso orario.
Se non si dovesse conoscere il tipo di server (UNIX, VMS, MVS, DOS, VxWorks) su cui risiedono i file del proprio sito internet è possibile anche lasciare l'opzione "Predefinito" che permetterà al software di riconoscere automaticamente il sistema in questione.
