Nello screenshot di figura è mostrato il menù "livelli" di Paint.NET dove è possibile aggiungere, eliminare e gestire i layer della modifica delle immagini.
Da questo menù è inoltre possibile applicare modifiche e regolazioni di colore, luminosità, saturazione e tonalità dei colori. Inoltre si possono anche ruotare e zoommare le immagini di piccole quantità scelte dall'utente.
