Nello screenshot di figura è mostrata la schermata principale di Paint.NET dove sono mostrati tutti gli strumenti e le finestre di gestione e modifica delle immagini.
L'interfaccia del software è molto simile a quella del Photoshop, di semplice ed immediato utilizzo, suddiviso in 4 pannelli principali:pannello degli strumenti, storia delle modifiche, tavolozza dei colori, finestra dei livelli e layers.
